Puzzle Quest: Galactrix é um game de puzzle situado em um futuro distante, com uma história rica e detalhada. Na trama, o jogador assume o papel de um novato piloto interestelar que está encarregado de ajudar a combater uma das quatro mega-corporações que dominam a galáxia, sendo uma delas a responsável por conduzir experimentos desconhecidos que podem colocar a espécie humana em extinção. Utilizando recursos parecidos com o de jogos já conhecidos - como Bejeweled e Hexic -, o game oferece quebra-cabeças formados por objetos hexagonais, que devem ser combinados em cores similares para adquirir pontos. As cores são um fator importante no game. Dependendo da cor utilizada para a combinação trazem diversos benefícios ao player, como regeneração dos escudos, aumento do nível de gasolina e poderes psíquicos.